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TCGA联合GEO铜死亡+铁死亡双热点联合分析文章套路

时间:2023-04-13 08:29来源:生信自学网 作者:伏泽 点击:
铜死亡+铁死亡双热点联合分析
课程目录:
铜死亡结合铁死亡文章套路简介,软件准备,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,差异分析,GEO数据下载,GEO数据注释,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,数据合并,提取差异基因表达量,生存分析,预后网络图,构建蛋白互作网络,瀑布图,提取预后基因的拷贝数,计算拷贝数变异频数,拷贝数圈图输入文件,拷贝数圈图,铜死亡和铁死亡分型,PCA分析,分型生存分析,分型热图,GSVA分析,免疫细胞差异分析,分型差异分析,GO富集分析,KEGG富集分析,基因分型,基因分型生存分析,基因分型热图,基因分型差异分析,PCA评分,PCA评分生存分析,PCA评分和生存状态的关系,桑基图,免疫细胞相关性分析,PCA评分差异分析,临床分组的生存分析,免疫检查点差异分析,列线图,ROC曲线,免疫组化。
 
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