除了基因组成的相似性, 在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体现基因组的共同起源, 这种基因排列顺序的一致性称为共线性(synteny, colinearity) 。  
Progressivemauve是一款以java编写全基因组比对软件，具有可视化界面，便于直接查看比对结果，特别适合于细菌等比对，而且能较好的处理进化距离较远的物种间的比对。 
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本课程是生物信息学专业课程，需要用到一些专业术语，遇到不明白的可以提问或者直接检索。 
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