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GTEx对几乎所有转录基因的基因表达模式进行了观察,从而能够确定基因组中影响基因表达的特定区域。 解决TCGA正常样品少/解剖图
课程内容:GTEx数据简介,GTEx和TCGA数据下载,GTEx数据库ID转换,统计各个器官表达量,解剖图绘制,箱体图绘制,提取GTEx对应组织表达,TCGA数据库分组,TCGA数据库ID转换,GTEx和TCGA数据合并,差异基因表达,热图绘制,生存分析输入文件准备,基因名字转换为基因ID,GO富集分析,GO圈图绘制,KEGG富集分析,KEGG圈图绘制。
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