ExoRBase数据库: 外泌体(exosome),是由细胞分泌的一种直径在30-150nm之间的囊泡,属于细胞外囊泡的一种,含有不同种类的RNA,可以调节受体细胞的行为,并且可以作为疾病的循环生物标记物,在血液,唾液,尿液等多种体液种都广泛存在。 exoRBase数据库收集的血液外泌体样本种各种RNA的数据,包括circRNA、lncRNA、mRNA等。一共92个样本,58330个circRNA、15501个lncRNA、18333个mRNA。 癌症种类:Normal正常样本32个 CHD冠状动脉心脏疾病6例 CRC结肠癌12例 HCC肝细胞癌21例 PAAD胰腺癌14例 BC乳腺癌2例 WhB全血样品5例购买课程:《exoRBase数据库挖掘》 课程目录: ExoRBase外泌体数据库简介,软件准备,exoRBase数据下载,mRNA差异分析,lncRNA差异分析,circRNA转换id,circRNA差异分析,预测mRNA结合的miRNA,预测lncRNA结合的miRNA,预测circRNA结合的miRNA,Cytoscape输入文件准备,调控网络可视化,symbol转换为id,GO富集分析,KEGG富集分析。预测mRNA结合的miRNA 软件:TargetScan、miRanda 预测lncRNA结合的miRNA 软件:miRcode
预测circRNA结合的miRNA 软件:ENCORI(以前叫starbase) 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |