m6A RNA甲基化5分文章套路视频(肿瘤分型/RNA修饰)...
GTEx(Genotype-Tissue Expression,基因型-组织表达)数据库,研究从来自449名生前健康的人类捐献者的7000多份尸检样本,涵盖44个组织(42种不同的组织类型),包括31个实体器官组织、10个闹...
单细胞测序数据挖掘视频(GEO数据库/scRNA-seq/PCA/ tSNE)...
可变剪切5分文章套路视频(预后相关的调控网络/TCGA数据库)...
中药复方网络药理学课程(中药有效成分/TCMSP/中药靶点/疾病基因)...
CCLE数据库挖掘视频(肿瘤细胞系/共表达/功能分析/GSEA富集)...
TARGET数据库挖掘,TARGET儿童肿瘤,批量生存分析,甲基化驱动基因,生物信息视频课程...
TCGA数据库批量挖掘lncRNA视频(批量生存曲线/长非编码RNA/COX模型)...
TCGA数据库,是癌症分析利器,可以免费下载整体好的基因在样本的表达量。本课程是生物信息学系列课程中重要的课程之一,内容精简,操作简单,案例选取一个癌症为例,经过15个课...
GEO数据库,是差异基因分析利器,可以免费下载芯片数据和平台文件。GEO芯片分析课程是生物信息学系列课程一个重要部分,学习GEO芯片分析是生物信息学习的基础课程。...
适用人群 生物信息学科研人员,医学工作者,学校生物信息学教师、学生。 课程概述 Cytoscape软件功能强大,是生物信息学分析利器,可快速构建基因关系网络,得到论文报告需要的效...
GO功能富集分析,是差异基因分析非常常见和重要的一个环节,是论文报告的标配,熟练掌握GO富集分析,为差异基因分析提供很多便利。...
蛋白互作网咯是讲解使用String在线工具构建蛋白互作网络,共表达网络讲解表达相关性,WGCNA构建共表达网络,Cytoscape构建共表达网络。...
miRNA靶基因预测是差异miRNA分析最重要的一步,如何获知miRNA的功能,可以通过预测miRNA靶基因的功能富集,推测miRNA的功能。miRNA靶基因预测的工具非常多。...
SEER数据库是癌症分析非常实用的数据库,是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一,收集了大量循证医学的相关数据,为临床医师的循证实践及临床医学研究提供了系统的证据...
讲解450K甲基化芯片,覆盖了96%的CpG岛,主要讲解从GEO数据库下载甲基化芯片,包括质控、归一化、差异甲基化位点、差异甲基化区域、差异甲基化区域注释。...
lncRNA靶基因预测,是lncRNA研究利器,lncRNA靶基因功能富集可以预测lncRNA的功能。...
ceRNA调控网络构建课程是TCGA数据库深度挖掘教程,课程从基础的数据下载,数据整理,到差异分析,比对分析,数据准备,网络构建,到最后得到网络,并对网络中的DE进行生存分析。...
16S rRNA基因分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中最常用和最有用的标志。...
GEO芯片分析是生物信息学基础课程,需要掌握,广大学员提出宝贵意见,精心录制GEO高级教程,多芯片联合分析,多芯片联合分析不是简单的做交集,而是利用RobusRank包做差异分析,得...
KEGG富集通路分析,是差异基因分析非常常见和重要的一个环节,是论文报告的标配,熟练掌握KEGG富集分析,为差异基因分析提供很多便利。 本课程内容精简,操作简单,精选案例,经...
GSEA根据已有的对基因的定位、功能、生物学意义等知识的基础上,首先构建了一个分子标签数据库,数据库中包括了多个功能基因集。通过分析基因表达数据,得到表达状况是否在某种...
GDSC数据库是抗癌药物敏感性数据库,收集肿瘤细胞对药物的敏感性和反应,这些数据对于发现潜在肿瘤治疗靶点十分重要。课程包括数据库简介、数据库在线操作(药物、基因及细胞系...
G小分子药物分析是对差异基因分析的一个重要补充,可以找到相关的小分子药物,利用CMAP数据库,就可以轻松找到小分子药物; 课程包括CMAP数据库简介,CMAP数据库输入数据准备,基...
课程讲解环状RNA测序分析,环形RNA式mRNA在剪接过程中,上游exon的5’端与3’端剪接到一起,从而形成的首位相接的环状RNA分析。本课程包括环状RNA简介,数据库准备和质控,比对到基因...
课程讲解PCA主成分分析, 主成分分析(Principal Component Analysis,PCA), 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂...
全基因组关联分析(Genome-wide association study)是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异,即单核苷酸多态性(SNP),从中筛选出与疾病相关的SNPs。...
RCircos R package绘制圈图,RCircos包支持Circos 2D数据轨道绘图,例如散点、线、柱状图、热图、连接器和文本标注。RCircos包直接从R中使用circos,免去了我们学习circos数据结构的过程,可以让...
课程讲解chip-seq分析简介,质控比对分析,peak可视化,peak注释。 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工...
除了基因组成的相似性, 在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体现基因组的共同起源, 这种基因排列顺序的一致性称为共线性(synteny, colinearity) 。 Progressivemauve是一款以java编写...
网络毒理学文章套路(化合物毒性分析/ProTox/ADMETlab/分子对接)...
泛癌孟德尔随机化分析视频(Pan-cancer/基因eQTL/TCGA数据库)...
迁移体文章套路...
可成药基因孟德尔随机化分析...
课程试学:单细胞联合孟德尔随机化分析...
通路孟德尔随机化...