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TCGA数据库蛋白质组学文章套路(蛋白预后模型/免

时间:2022-06-08 09:54来源:生信自学网 作者:伏泽 点击:
TCGA数据库蛋白质组学文章套路(蛋白预后模型/免疫组化)
课程目录:
TCGA蛋白质组简介,软件准备,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,蛋白表达数据下载,蛋白数据整理,蛋白表达数据和生存数据合并,蛋白预后模型构建,分组的临床统计分析,预后火山图,PCA分析,生存分析,PFS分析,模型蛋白的生存分析,风险曲线,独立预后分析,ROC曲线,列线图,临床分组的模型验证,临床相关性分析,共表达圏图,共表达桑基图,免疫组化,提取泛癌表达数据,泛癌差异分析,GSEA富集分析,免疫细胞浸润,免疫细胞差异分析,免疫细胞雷达图,TIDE免疫治疗分析,TCIA免疫治疗分析,样品分型,分型的生存分析,分型的临床相关性分析。
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