TCGA数据库差异分析生存分析视频教程
时间:2018-07-20 06:41来源:原创 作者:BioWolf 点击:
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TCGA数据库,是癌症分析利器,可以免费下载整体好的基因在样本的表达量。本课程是生物信息学系列课程中重要的课程之一,内容精简,操作简单,案例选取一个癌症为例,经过15个课
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适用人群
TCGA数据挖掘的科研人员,癌症相关研究人员,生物信息学分析员,生物、计算机相关专业师生,医学研究人员
课程概述
TCGA数据库,是癌症分析利器,可以免费下载整体好的基因在样本的表达量。
本课程内容精简,操作简单,案例选取一个癌症为例,经过15个课时的学习,就可以熟练挖掘TCGA数据库,分析癌症数据。
同时提供课程需要的脚本文件,老师在线回答学员问题。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。
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师资
讲师:光俊
严谨的治学风格,课程讲解简单易学,讲师生物信息科班出身,从事生物信息相关工作8年,熟悉操作各类生信软件,语言编程。精通GEO芯片分析,TCGA数据库挖掘。
课程目录
章节1:TCGA数据库数据下载整体
课时1:TCGA数据库简介
课时2:TCGA数据库网页下载数据
课时3:TCGA数据库命令行下载数据
课时4:TCGA数据库原始数据提取矩阵文件
课时5:TCGA数据库ID转换成基因名
章节2:TCGA数据库GENE差异表达分析
课时6:TCGA数据库差异表达介绍
课时7:TCGA数据库用edgeR包做差异分析
课时8:TCGA数据库用DESeq包做差异分析
章节3:TCGA数据库miRNA差异表达
课时9:TCGA数据库miRNA数据下载与整体
课时10:TCGA数据库miRNA差异表达分析
章节4:TCGA数据库共表达分析
课时11:TCGA数据库共表达数据合并
课时12:WGANA做共表达网络
章节5:TCGA数据库做生存分析
课时13:TCGA生存分析数据准备
课时14:TCGA数据用R做生存分析
课程特色
责任编辑:伏泽
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