TCGA数据库包括丰富的数据类型和肿瘤类型,不需要任何费用即可获得大量数据,其次在TCGA下载的数据已经经过了前期繁琐的标准化处理,节省了人工处理时间和资源。 甲基化驱动基因分析,主要用到MethyIMix分析方法:1、计算基因甲基化水平和基因表达相关性,找到显著相关的基因。 2、对样品甲基化程度构建混合模型(mixture model) 3、Wilcoxon rank test计算正常组和处理组的差异甲基化 4、对计算的p值进行矫正 课程包括以下及部分的内容: 1、甲基化驱动基因课程简介 2、甲基化驱动基因数据准备 3、甲基化驱动基因MethyIMix数据分析 4、甲基化驱动基因MethyIMix绘制图形 5、甲基化驱动基因热图绘制
6、甲基化驱动基因PATHWAY分析 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |