ICGC数据库SNP数据下载

前面我们已经介绍过这个数据库，也有一个ICGC数据库挖掘的课程，今天我们给大家介绍一下如何使用ICGC数据库下载SNP数据。
1、进入ICGC数据库官网，进入ICGC的官方有两个地方可以下载数据，DCC Data Releases和Data Repositorles，Data Repositorles点进去的界面和TCGA数据库界面类似，但是下载不是很方便，我们直接进入DCC Data Releases下载打包好的数据：

2、选择数据版本，当然在这里我们都是选择最新版的数据，我们需要提醒大家的是，不论是TCGA数据库还是ICGC数据库，生信自学网否反复强调要大家从官网下载数据，其他聚到获取的数据没有及时更新，或者其他原因都会影响分析。

进入下一级页面，直接选择“Projects”

3、进入癌症选择页面，在这一步，我们需要选择数据类型和数据来源，根据自己的分析，选择数据，比如我们在这里选择日本肝癌的数据，[LINC-JP] Liver Cancer - NCC, JP
每个癌症的数据类型都不是统一的，所以需要大家根据研究点进去看是否和含有自己研究的数据，SNP突变数据在很多癌症都存在，正好我们这里讲解的就是SNP突变数据分析。

在查找数据时，我们一般先限定癌症类型，然后找到该癌症的数据，有些癌症有多个机构提供，可以分别点进去看是否符合分析要求，在决定选哪份数据。
4、选择好数据类型之后，我们就进入了数据下载页面，在这个页面，我们可以有病人信息，样本信息，表达文件，SNP突变文件，当然如果大家选择其他癌症，内容可能不同，我们可以把这些数据都下载下来，然后选其中的SNP数据做后续的分析。