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一、R下载
网址：https://www.r-project.org/
二、R简介
R是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的S语言的一个分支。可以认为R是S语言的一种实现。
而S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析和作图的解释型语言。
R作为一种统计分析软件，是集统计分析与图形显示于一体的。
R语言之父：Ross Ihaka
特点：
1.R是自由软件。这意味着它是完全免费，开放源代码的。
2.R是一种可编程的语言。
3. 所有R的函数和数据集是保存在程序包里面的。
4.R具有很强的互动性。
install.packages("colorspace")
install.packages("stringi")
install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("clusterProfiler")
library(clusterProfiler)
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("limma")
library(limma)
安装R包常见的错误：
1、安装目录不对，安装目录不可以有中文和空格，最好安装在默认的C盘
2、输入的命令不对，例如BiocManager就在2020年底更新过一次命令
之前的：
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("limma")
现在的：
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("limma")
3、R版本不对，如果R版本太低，很多命令安装会出错，现在用到了R4.0.5
4、网速问题，这个时候一般会显示下载错误，或者50M的包才下载了10M，会提取错误
可以换个好点的宽带或者用手机热点
5、安装目录的文件夹没有用户权限，这个时候可以设置所有用户的所有权限
6、镜像不对，首先我们看下如何查看选择镜像，每次开启R，输入安装命令都会弹出一个框
就是选择镜像的，一般选择中国Lanzhou，如果遇到这个镜像安装不了，用第一个镜像试下
options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
7、电脑如果开过翻墙软件，关掉
责任编辑：伏泽 作者申明：本文版权属于生信自学网（微信号：18520221056）未经授权，一律禁止转载！ |
