在学习《GTEx联合TCGA挖掘》、《单细胞测序GEO芯片挖掘》时,经常有学员遇到个别R包无法安装的问题 大部分情况,时因为网速限制的问题,因为从github下载R包需要一定的网速,如果是用网忙时一般都会遇到报错,比如: 看下两个包的安装脚本: 1、SingleR (主要用于注释细胞类型,非常好用的一个R包) #install.packages("devtools") #library(devtools) #devtools::install_github('dviraran/SingleR') 2、gganatogram包 (主要用于绘制解剖图) #install.packages("devtools") #library(devtools) #devtools::install_github("jespermaag/gganatogram") 从命令我们很容易看出,从github下载R包都是通过devtool工具,很多学员在安装和调用devtools包经常会出现类似报错的信息,其实这个包安装很容易,基于R3.6.1,可以很快安装调用,到了devtools::install_github("jespermaag/gganatogram")这句命令,就需要网速比较好,一般凌晨用网闲时,下载数据比较快,以下界面是在凌晨5点下载的界面,供大家参考: 1、工具:R 3.6.1 2、网络:电信(这个其实也挺重要,其他宽带上外网比较难) 3、输入安装命令 生信自学网课程推荐: 《GTEx联合TCGA数据库挖掘》 《单细胞测序GEO芯片挖掘》 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |