SEER数据库使用，需要注册一个账号，然后按照数据库后台指示，需要对承诺书签名，扫码再给后台发邮件，得到回复就可以获得用户名和密码，有了用户名和密码就可下载数据和其他软件。 SEER数据库的数据不想其他数据库的数据，下载下来就可以直接进行分析，下载的数据需要选择性处理，才能得到我们需要的数据。  提取时我们一般用到的是perl脚本，当然在提取之前，需要准备几个选择的文件，也就是我们需要选择的癌症类型，需要下载数据的字段，比如需要分析黑人的癌症，选择性别和生存时间，生存状态，都是需要选择对应的字段，当然数据库后台会提供一个说明的pdf文件，这个文件很大，包括了seer数据库所有癌症类型及所有的字段，这个文件对seer数据库分析非常有用，在分析过程中会经常用到。  提取到需要的数据文件，我们就可以使用R软件，用survival包做生存曲线分析，比较简单的就是离散字段的生存曲线，比如性别，有男性和女性。有些是连续数据的字段，比如说分析生存期与年龄的关系，时间是个连续的，我们就需要分几个阶段，比如<60，60<x<70,70<x<80，大于80，这样分析也可以得到生存曲线。  连续变量生存曲线  
责任编辑：伏泽 作者申明：本文版权属于生信自学网（微信号：18520221056）未经授权，一律禁止转载！ |
