上次推文之后,有很多学员问到ceRNA、Cox风险模型、GEO多芯片联合分析、甲基化与基因联合分析的分析思路,我们在之前发文的基础上,给大家总结思路,希望对大家有帮助,当然最实惠的办法是学习课程,最高效的办法是找我们直接做分析。 1、数据下载
从TCGA数据库下载level3的RNA-seq数据 数据下载差异分析可以学习:TCGA基础课程
4、单因素Cox分析 5、多因素Cox分析 风险模型:
同时绘制生存曲线
6、ROC曲线 7、使用survival R包绘制ROC曲线7、风险曲线和热图
根据公式和每个样品的表达量得到每个样本的生存打分
8、独立预后因子 想得到上面的表和图可以学习:GO富集分析
10、kegg富集分析 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |