GSEA官网:https://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp 数据下载: 1、进入主页,点击Downloads导航菜单 2、输入邮箱,点击login,如果还没有注册,可以注册一个账号,GSEA注册非常简单 3、进入下载页面,根据自己的操作系统选择合适的版本下载,比如win系统下载GSEA v4.0.3 for Windows 4、安装好之后,桌面就出现了GSEA的软件图标 5、点击页面导航菜单:Molecular Signatures Database,进入数据集下载页面 6、点击页面的搜索按钮:Search for gene sets by keyword. 7、进入搜索页面,在搜索框输入糖酵解的关键词:glycolysis,点击search按钮开始搜索 8、得到结果页面,在数字框下拉选择100,也就是显示所有相关数据集,这里我们可以选择数据集名称有glycolysis的数据集 9、选择好数据集,点击数据集的name,比如:BIOCARTA_GLYCOLYSIS_PATHWAY 10、进入BIOCARTA_GLYCOLYSIS_PATHWAY该数据集的页面,点击gmt按钮下载gmt文件,可以重命名为BIOCARTA_GLYCOLYSIS_PATHWAY.gmt 用相同的方法下载其他糖酵解相关的数据集 购买课程《糖酵解预后模型文章套路》 精品课程推荐: 《TCGA免疫相关基因预后模型》 《TCGA免疫相关lncRNA预后模型》 《免疫基因对文章套路挖掘》 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |