一项基于TCGA数据挖掘的研究（三）

BTK有可能成为TME调节的指标
考虑到BTK水平与LUAD患者的生存和TNM分期呈负相关，高表达组和低表达组分别与BTK表达中位水平相比实施GSEA。如图7A和补充表2所示，BTK高表达组基因主要富集于免疫相关活性，如异体排斥反应、补体、干扰素等。对低表达组杀人案,代谢途径的基因丰富,包括糖酵解、氧化磷酸化,和典型的肿瘤通路(图7 b和补充表2),C7收集由MSigDB免疫基因集,多个免疫功能基因集富集在高对表达式组杀人案(图7 c和补充表2)。然而,在低BTK表达组中，只有少数基因组富集(图7D和补充表2)。这些结果表明，BTK可能是TME状态的潜在指标。

图7| BTK高表达和低表达的样品|GSEA(A)高BTK表达样本贺曼采集的富集基因集。每条线代表一个具有独特颜色的特定基因集，上调的基因位于左边接近坐标原点的位置，下调的基因位于x轴的右边。只有NOM p &lt基因集0.05和FDR q <0.06被认为显著。而且只有几个主要的基因集显示在该图谱中。(B) BTK低表达的样本在HALLMARK的富集基因集。(C) BTK高表达样本在C7收集的免疫基因集中富集。图中只显示了几个主要的基因集。(D) BTK低表达富集C7基因集。

BTK与抽搐比例的相关性
进一步证实对表达与免疫微环境,杀人案的相关性tumorinfiltrating免疫子集的比例进行了分析使用CIBERSORT算法,和21种免疫细胞在LUAD样本构造(图8)。结果的差异和相关性分析表明,总共有八种抽搐与BTK的表达(图9中,补充图1,表3和补充)。其中,5种TICs与BTK表达呈正相关，包括b细胞记忆、CD8+ T细胞、单核细胞、静止树突状细胞和静止肥大细胞;三种tic与BTK表达呈负相关，分别为活化的NK细胞、巨噬细胞M0和活化的肥大细胞。这些结果进一步证实了BTK水平影响TME的免疫活性。

图8|肿瘤标本|TIC剖面及相关分析(A)显示21种TICs在LUAD肿瘤样本中所占比例的Barplot。plot的列名为sample ID。(B)表示21种TICs相关性的Heatmap和每个小方框中表示两种cell相关性p值的数值。每个小彩盒的色度表示两个细胞之间对应的相关值，Pearson系数进行显著性检验。

图9 |TICs比例与BTK表达的相关性

在本研究中，我们试图从TCGA数据库中识别与tme相关的基因，这些基因有助于LUAD患者的生存和TNM分期的分类。BTK被证实参与免疫活动。重要的是，一系列生物信息学分析表明BTK可能是LUAD患者TME状态的一个指标。TME在肿瘤发生的起始和进展中起着重要的作用。探索TME重构的潜在治疗靶点，促进TME从肿瘤友好型向肿瘤抑制型转变，具有重要意义。大量的研究已经阐明了免疫微环境在肿瘤发生中的重要性。我们对TCGA数据库中LUAD数据的转录组分析结果表明，TME中的免疫成分对患者的预后有影响。特别是TME中免疫和基质成分的比例与LUAD的进展如侵袭和转移显著相关。这些结果突出了探索肿瘤细胞与免疫细胞相互作用的重要性，为开发更有效的治疗方案提供了新的见解。

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