如何绘制免疫细胞相关性的雷达图雷达图可以用来展示免疫细胞相关性的结果,在上一篇文章中得到了免疫细胞的相关性文件,我们可以用得到的免疫细胞相关性文件来来绘制雷达图。下面是我们最终得到的雷达图结果 我们来看一下这个图形,这个图形每个线段代表一个免疫细胞,这个图形里面有两天不同颜色的曲线,红色的曲线代表高风险组里面免疫细胞的含量,蓝色代表低风险组里免疫细胞的含量。有些免疫后加有星型符号,这个代表这个免疫细胞的差异是显著的,星星越多表示越显著。通过这个雷达图,我们可以很直观的展示免疫细胞相关性的结果。 接下来我们看一下绘制这样的雷达图需要准备什么样的输入文件,输入文件就是我们上一篇文章中得到的雷达图的输入文件fmsbInput.txt以及相关性结果的统计文件corStat.txt。 我们先来看一下相关性的统计文件 它的第一列是免疫细胞的名称,第二列是P值,第三列是它的显著性 然后是雷达图的输入文件 里面有高风险组里免疫细胞的含量和低风险组里免疫细胞的含量。 有了这两个文件后,我们就可以利用我们的脚本文件来绘制雷达图,用R运行脚本文件后,我们就可以得到免疫细胞相关性的雷达图了。 视频购买链接: 《免疫基因对文章套路视频》 精品课程推荐: 《GEO数据库miRNA芯片挖掘》 《甲基化肿瘤分型文章套路视频》 《TCGA肿瘤免疫细胞浸润模式挖掘》 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |