自噬基因预后模型文章套路视频(autophagy/多指标ROC曲线)...
如何用TCGA数据库做自噬相关基因预后分析,是生信分析的一个新的热点和难点,自噬相关基因的重要性决定了其研究的重要地位。...
如何获取自噬基因::网址:http://www.autophagy.lu/...
TCGA甲基化分析是当前分析的热点,也是TCGA分析的蓝海,具有很强的分析价值。...
TCGA数据库挖掘,癌症分析首选数据库,Cox比例风险回归模型是TCGA分析一个非常重要的方法,同时也是一个发文热点。...
继TCGA基础课程、Cox风险模型、ceRNA网络构建课程推出之后,在学员强烈要求下,我们的程序员、授课老师合理规划,协同合作,经过半年的努力,终于推出了《TCGA甲基化基础课程》、《...
这注定是个不平凡的夏天,世界杯正在热播,我们的研究没有停歇,在这个忙碌的夏天,我们精心录制了三个课程,现在各平台均已上线,各位学员在看世界杯的空余,可以学习课程,...
TCGA突变数据分析...
在这个分析思路中,最关键的一步就是如何用CIBERSORT这个软件把基因矩阵转换为免疫细胞矩阵。...
免疫浸润是一个非常经典的思路,通过简单的基因矩阵数据,我们将复杂实验才能提取的免疫细胞含量直接计算出来,对科研工作非常有帮助。今天我们来讲讲,通过肿瘤免疫浸润分析...
大数据时代,生物数据越来越多了,数据库也越来越多了,各种各样的基因芯片数据库、蛋白质数据库...琳琅满目...
在肿瘤微环境中,免疫细胞和基质细胞是两种主要类型的非肿瘤组分,并且已被提出对于肿瘤的诊断和预后评估具有价值的。...
肿瘤突变负荷是一个比较热门的分析,而且频繁用于各大医院临床应用,通过肿瘤突变负荷的程度,可以预测生存期,以及病人的免疫治疗的疗效。...
RNA修饰是一种转录后水平的调控方式,目前已鉴定到超过150种RNA修饰,它们广泛分布于各类RNA,如信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、非编码小RNA(sncRNA)和长链非编码...
m6A RNA methylation文章解读...
TCGA数据库癌旁样本少(没有癌旁)怎么办? GTEx数据库联合TCGA做分析 通常我们在挖掘TCGA数据库的时候,会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的,也就是说很多病人都不会有...
你是否遇到这样的问题,TCGA癌旁太少甚至没有,做免疫做到后面癌旁样本只剩下5个一下的个位数,审稿人冷不丁的来一句这么少的癌旁有没有意义?那么有了GTEx数据库,有正常样品助...
既然免疫治疗是否有抗癌效果,主要依赖于免疫细胞对癌细胞特异性抗原的识别;那么,从理论上讲,那些携带基因突变越多的癌症患者,癌细胞产生的新抗原越多,被免疫细胞识别的...
详细分析了10万例肿瘤患者的标本和临床资料,深度解析了有关TMB、PD-1抑制剂、MSI以及遗传物质错误修饰等关键问题。...
COX模型验证如何分train组和test组,可以购买生信自学网录制的专利视频课程《COX模型验证》...
《TCGA数据库可变剪切数据挖掘》5分套路分析课程正在制作,大家可以重点了解下7种可变剪切类型。...
Genome-Wide Profiling of Prognostic Alternative Splicing Signature in Colorectal Cancer...
【可变剪切文献解读】Alternative splicing events implicated in carcinogenesis and prognosis of colorectal cancer...
Comprehensive Analysis of Alternative Splicing Across Tumors from 8,705 Patients,8705例肿瘤样本选择性剪切的综合分析...
Exploration of methylation‑driven genes for monitoring and prognosis of patients with lung adenocarcinoma 甲基化驱动基因监测肺腺癌患者预后的探讨...
可变剪切(alternative splicing,AS),也叫做选择性剪切,指的是再mRAN前体到成熟mRNA的过程当中,不同的剪切方式使得同一个基因可以产生多个不同的成熟mRNA,最终产生不同的蛋白质。...
TCGA数据库现在是生信分析的热点,生信自学网开创了用生信方法解读TCGA数据的先河,给研究者提供了新的研究方案。...
学员又发文了,ceRNA网络构建,原来SCI发文可以通过学习做到,而且只要认真学习我们的课程,课程的数据和结果可以直接上论文。...
而你看到的课程,是我们3个生信大神老师,经过半年对TCGA数甲基化数据魔鬼化分析得到大作。...
新年新气象,TCGA迎来新一次改版,和以往的改版如出一辙,改动的是网页的格式和链接,数据并没有做修改,提供的指导性文件更多更人性话了,这也是所有TCGA研究者的福音。...
癌症相关成纤维细胞CAF生信套路...
1、免疫细胞浸润 2、免疫细胞的相关性...
这里教大家如何在GSEA上下载GO的数据集。...
临床数据的下载及整理...
肿瘤干细胞(Cancer Stem Cell, CSC),是指肿瘤中具有自我更新能力并能...
免疫基因对最后一节教大家如何绘制GSEA富集结果的气泡图...