绘制生存状态图上一篇文章我们介绍了如何绘制风险热图和风险曲线图,这一次我们教大家绘制最后一张生存状态图。我们先来看一下我们要得到的生存状态图 生存状态图,它的横坐标和前面我们提到的两张图是一样的,也是将病人按照风险值由低到高排序。排序好了之后,我们就把病人的生存时间标上去,也就是说我们这里的纵坐标就是病人的生存时间,然后我们也会把这个病人的生存状态通过不同颜色的点标上去,红色的点它代表病人已经死亡,绿色的点就代表这个病人还存活着。 所以从这个图里面我们可以看到随着这个风险值的增大,死亡的病例越来越多,然后同时我们也可以看到生存时间,左边的生存时间相对于右边来说要高一些,随之风险的增大,生存时间也就降低了,死亡的人数也就增加了。 下面我们来绘制这个图形,绘制这个图形的输入文件和前一篇文章讲的一样,也是risk.txt文件,脚本文件的话是我们自己准备好的文件,大家可以通过购买我们的课程获得该套课程的学习视频和脚本文件。 通过R运行我们的脚本文件,我们就可以得到我们需要的生存状态图了。 课程链接: TCGA数据库批量挖掘lncRNA视频 相关课程: 长非编码RNA芯片数据挖掘视频 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |