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KEGG富集分析 KEGG Pathway富集图

时间:2017-05-30 04:35来源:原创 作者:BioWolf 点击:
KEGG富集分析分析差异基因非常重要的方法,出现在论文的概率非常高,熟练掌握KEGG富集分析对后期写论文作用非常大。

KEGG富集分析的在线工具主要有KOBAS,还有一些研究人员使用DAVID,这两个时非常专业和常用的,这里主要讲解KOBAS3.0的使用方法。DAVID在线工具的使用可以参照:GO富集分析

KOBAS的使用方法比较简单,需要准备需要分析的Entrez Gene ID。

KOBAS的官网:KOBAS3.0

KEGG富集分析步骤:
1、准备一个TXT文件,保存好需要分析的symbol
2、把Symbol ID转换成Entrez Gene ID,如果有Entrez Gene ID忽略这一步。
3、输入到KOBAS的输入框内,选择好物种,选择输出的类型,我们一般选择
KEGG Pathway。
4、下载相关的富集图,和富集文件,分析富集文件,这里可以用R软件做一个PValue的富集图。
这样简单的步骤,估计还不是很明白,那么需要学习专业的视频,一步一步安装视频的讲解来操作:




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电脑浏览器可以直接观看,记得关注公众号。
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