GEO NCBI数据下载与提取视频教程
时间:2017-08-16 10:01来源:原创 作者:BioWolf 点击:
次
生信自学网提供GEO芯片数据下载视频教程,学习生物信息学,视频教程更容易入门,操作更简单,希望对初级学员有帮助。
GEO NCBI数据库可以免费下载很多芯片数据,包括基因表达芯片,miRNA表达芯片,甲基化芯片,需要做差异分析,选择GEO数据库下载芯片数据是一个不错的选择。
在数据检索之前,我们需要知道自己研究的方向,这个方向有哪些关键字,做到心中有数,进入数据库可以检索相关数据,检索到数据之后就可以下载。
在芯片选择是需要注意一些问题,首先是芯片的时间,不能是很久以前的芯片,最好选择2010年以后的芯片数据,芯片样本,样本不要选择太少的,样本数目对后续差异分析非常关键,一般样本包括正常和Tumor;芯片平台,查看芯片品台,选择常用的平台,每个平台使用的基因ID有所不同,选择合适的平台,后续分析少很多工作,有些平台是直接用gene symbol,而有些用的是Ensembl ID,那么差异分析之前还要做ID转换。
如果手机不支持在线播放,那么可以选择电脑浏览器播放,或者关注微信公众号,里面有视频资料-免费视频教程,也可以学习免费视频。
责任编辑:伏泽
作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载!
|
BioWolf二维码生成器
------分隔线----------------------------