CGGA数据库数据下载数据库网址:cgga.org.cnCGGA数据库简介CGGA数据库是一个用户友好的网络应用程序,用于数据存储和分析,以探索来自中国队列2000多个样本的脑肿瘤数据集。该数据库包括全外显子测序(286)、DNA甲基化(159)、mRNA测序(1018)、mRNA微阵列(301)和microRNA微阵列(198)以及匹配的临床数据。分析工具允许用户浏览DNA突变谱、mRNA/micorrna表达谱和甲基化谱,并对特定的胶质瘤亚型进行相关性和生存率分析。
主页界面
CGGA数据库的界面简洁友好,下载数据非常简单,选择DOWNLOAD菜单就可以进入下载界面 进入下载界面,我们选择需要的数据下载就可以了,我们这里给大家介绍的是mRNAseq数据,下载mRNAseq和样本的临床数据,CGGA数据库只有胶质瘤的数据,数据整理的也比较规范,所以后期分析也不像TCGA那么复杂
下载mRNAseq_693和mRNAseq_325的数据和临床数据用于后面做分析
下载之后解压我们就得到了这些数据,那么接下来把mRNAseq_693和mRNAseq_325数据整合在一起做后续的分析呢 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |