TCPA蛋白数据库多指标ROC曲线绘制 ROC曲线的作用:用于检验模型验证病人生存的准确程度,参数AUC值也就是曲线下面积,AUC值介于0.5-1之间,AUC值越大,说明模型的准确性越高,一般认为AUC值>0.7是比较理性的结果 输入文件:独立预后模型分析用到的输入文件indepInput.txt,包含样本ID,生存时间,生存状态,各临床指标,风险值risk score R包:install.packages("survivalROC") 调用R包:library(survivalROC) 函数:survivalROC() predict.time=1(输入文件futime的单位是年,这里设定为1,绘制1年的ROC曲线) 横坐标假阳性率,纵坐标真阳性率 绘制好模型risk score的ROC曲线之后,就绘制其他临床的ROC曲线,把多指标ROC绘制在一个图形里面,得到最终的结果 精品课程推荐: 《中药复方网络药理学联合GEO》 《单细胞测序分析》 《TCGA单基因发文套路挖掘》 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |