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  • [生信数据库] TARGET儿童肿瘤数据库下载临床和mRNA-seq数据 日期:2019-07-30 07:14:35 点击:18366 好评:-2

    TARGET数据库是儿童肿瘤数据库,适合做儿童肿瘤分析和挖掘,对TCGA数据库做了很好的补充,而且针对性更强。...

  • [生信数据库] ArrayExpress数据库挖掘(类似GEO数据库的另一个芯片 日期:2019-04-19 06:46:27 点击:3944 好评:8

    ArrayExpress与Geo数据库类似,里面都存储这大量芯片表达数据,对于数据库挖掘的学员来说,ArrayExpress是一个不可或缺的数据库。...

  • [生信数据库] 中药网络药理学分析思路探讨 日期:2019-01-17 14:50:45 点击:4541 好评:-6

    网络药理学是基于系统生物学理论,对生物系统的网络分析,选取特定信号节点进行多靶点药物分子设计的新学科。...

  • [生信数据库] R语言学习资料大全(持续更新) 日期:2017-11-07 11:54:22 点击:3045 好评:6

    学习R语言可以利用很多资源,学习这些资源可以更好的学习R语言,生信分析R语言...

  • [生信数据库] 高通量测序数据发文思路 日期:2017-08-15 07:27:17 点击:4720 好评:10

    随着高通量检测(基因芯片/二代测序)价格的降低,全基因组检测也成为较为常规的实验之一。然而面对动辄几万个基因的高通量数据,后期的数据分析显得尤为重要。...

  • [生信数据库] TCGA差异基因做火山图 日期:2017-08-12 07:13:14 点击:15940 好评:2

    TCGA数据库数据下载得到表达矩阵,用表达矩阵做差异分析,可以得到差异基因,以及差异基因相关的logFC和矫正后的P值,利用这两列数据可以画一个火山图,直观表示差异基因的上调下...

  • [生信数据库] lncRNA深入分析方法 日期:2017-08-12 04:29:22 点击:4085 好评:0

    长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。 研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生...

  • [生信数据库] miRNA命名规则 日期:2017-08-11 20:23:04 点击:6099 好评:0

    以动物microRNA为例 一、 确定命名规则之前发现的microRNA,则保留原来名字,如cel-let-7。 二、 在提交新的microRNA到数据库时,按照microRNA family顺序分别编号命名,如数据库中已有mir-41,那...

  • [生信数据库] Affymetrix芯片数据上传到GEO数据库 日期:2017-08-11 20:05:17 点击:2078 好评:4

    GEO数据库上传芯片数据...

  • [生信数据库] circRNA环状RNA功能分析 日期:2017-08-09 07:08:49 点击:6338 好评:4

    circRNAs 由于其特有的结构和复杂的功能机制,对其研究起步较晚,但已证实其具有重要的调控作用并在疾病发生中发挥重要作用,成为 RNA 和转录组研究的热点。...

  • [生信数据库] PCA主成分分析 日期:2017-07-18 14:26:37 点击:1985 好评:-2

    主成分分析(Principal Component Analysis,PCA), 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。...

  • [生信数据库] RCircos圈图绘制 日期:2017-07-13 05:35:49 点击:5440 好评:0

    RCircos圈图用途广泛,特别是二代测序的文章,在很多文章都会用上圈图,SNP位点,基因的表达量,基因间的共表达关系,在生物学领域应用广泛。...

  • [生信数据库] 环状RNA测序数据分析 日期:2017-07-10 12:05:05 点击:2568 好评:2

    环状RNA简介,环状RNA注释、鉴定,差异分析,生存分析...

  • [生信数据库] R语言&软件免费视频教程 日期:2017-07-04 10:56:37 点击:2345 好评:0

    生物信息学R语言系列课程由biowolf.cn原创录制,旨在完善生物视频教程生态圈,满足广大学员对R语言深入学习的要求,在之前的生信课程中,经常用到R软件和R脚本,很多时候我们都会给...

  • [生信数据库] 转录因子结合位点TFBS预测 日期:2017-06-27 13:23:00 点击:3164 好评:0

    课程讲解转录因子及转录因子结合位点的预测,转录因子能够结合在某因子上游特异核苷酸序列上的蛋白质,活化后从胞质转位至胞核,通过识别和结合基因启动子区的顺式作用原件,...

  • [生信数据库] 在线分析GDSC抗癌药物敏感性数据库 日期:2017-06-09 16:07:57 点击:8777 好评:6

    GDSC数据库进入网站就可以得到很多有用的数据,在线可以生成IC50半浓度图,火山图,单个多个癌症的药物敏感性散点图,所以说这个数据库非常实用。...

  • [生信数据库] GDSC抗癌药物敏感性数据库分析简介 日期:2017-06-09 15:59:16 点击:15062 好评:0

    抗癌药物敏感性基因组学(GDSC,Genomics of Drug Sensitibity in Cancer)有英国桑格研究院开发,收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应。癌基因组的变异会影响临床治疗的效果,不同的靶点对药...

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