数据下载 网址:http://www.cbioportal.org/ 1、进入官网,点击“Data SET” 菜单 2、进入数据页面,在搜索框输入“metabric” 3、点击下载按钮,就可以把数据下载下来,METABRIC数据库只有乳腺癌的数据,所以下载数据非常简单 有学员会有以为,如果METABRIC数据库只有乳腺癌的数据,那么是不是只能做一次分析,剩下的都会重复,其实不然,我们课程用的是单基因筛选的方法,最后得到很多基因,然后根据自己的分析选择其中一个基因就可以做后续分析了。 4、接下来我们看下下载好的数据 Data_CNA.txt 拷贝数数据 Data_mRNA_median_Zscores.txt 表达数据(用Zscores方法矫正后的数据) Data_clinical_patient.txt、data_clinical_sample.txt 保存了临床数据 那么我们新推出的课程用到的就是表达文件和临床文件 精品课程推荐: 《TCGA转录组和甲基化联合分析》 《TCGA免疫预后相关基因挖掘》 《GEO芯片联合中药复方网络药理学》 责任编辑:伏泽 作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载! |