生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

KEGG富集分析视频课程

KEGG富集通路分析，是差异基因分析非常常见和重要的一个环节，是论文报告的标配，熟练掌握KEGG富集分析，为差异基因分析提供很多便利。 本课程内容精简，操作简单，精选案例，经...

GSEA富集分析视频课程

GSEA根据已有的对基因的定位、功能、生物学意义等知识的基础上，首先构建了一个分子标签数据库，数据库中包括了多个功能基因集。通过分析基因表达数据，得到表达状况是否在某种...

GDSC数据库分析视频课程

GDSC数据库是抗癌药物敏感性数据库，收集肿瘤细胞对药物的敏感性和反应，这些数据对于发现潜在肿瘤治疗靶点十分重要。课程包括数据库简介、数据库在线操作（药物、基因及细胞系...

CMAP数据库小分子药物分析视频（生物信息学视频

G小分子药物分析是对差异基因分析的一个重要补充，可以找到相关的小分子药物，利用CMAP数据库，就可以轻松找到小分子药物； 课程包括CMAP数据库简介，CMAP数据库输入数据准备，基...

环状RNA分析视频教程（生物信息学视频/TCGA数据库

课程讲解环状RNA测序分析，环形RNA式mRNA在剪接过程中，上游exon的5’端与3’端剪接到一起，从而形成的首位相接的环状RNA分析。本课程包括环状RNA简介，数据库准备和质控，比对到基因...

PCA主成分分析（生物信息学视频/GEO芯片分析）

课程讲解PCA主成分分析， 主成分分析（Principal Component Analysis，PCA）， 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法，它可以从多元事物中解析出主要影响因素，揭示事物的本质，简化复杂...

全基因组关联GWAS分析视频教程

全基因组关联分析（Genome-wide association study）是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异，即单核苷酸多态性（SNP），从中筛选出与疾病相关的SNPs。...

RCircos圈图绘制视频教程

RCircos R package绘制圈图，RCircos包支持Circos 2D数据轨道绘图，例如散点、线、柱状图、热图、连接器和文本标注。RCircos包直接从R中使用circos，免去了我们学习circos数据结构的过程，可以让...

chip-seq生物信息分析视频教程

课程讲解chip-seq分析简介，质控比对分析，peak可视化，peak注释。 染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工...

多基因组比对和共线性分析视频教程

除了基因组成的相似性, 在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体现基因组的共同起源, 这种基因排列顺序的一致性称为共线性(synteny, colinearity) 。 Progressivemauve是一款以java编写...