外显子测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后,再进行高通量测序的基因组分析方法。 外显子信息流程:下载数据库,下载原始数据,质控,比对,SNP、I...
小RNA是一类长度在18-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA。小RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色。 课程讲解数据下载,质控...
本课程讲解转录组测序分析简介,数据准备与质控,比对和表达量计算,差异表达,新转录本和新lncRNA。 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的...
SEER数据库,是癌症分析利器,可以下载癌症样本详细的临床数据,高级进阶课程讲解如何从SEERStat下载数据,整理竞争风险模型输入数据,用R做竞争风险模型曲线图,SEERStat整理和下载...
用Stata14软件做网状meta分析,用R软件做网状meta分析,二分类变量、连续变量分别做网状meta分析。...
TCGA数据库分析可以得到差异基因,提取简单的临床信息,生存时间和生存状态,合并临床和差异基因数据,做Cox比例风险模型,是当前TCGA数据库挖掘的热门课题。...
本课程讲解使用R软件绘制热图,输入文件有两个,一个是差异基因表达量文件,一个是样本代号分类文件,对差异基因做聚类分析经常用到,论文报告上出现的频率高。 ...
16S rRNA基因分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中最常用和最有用的标志。16s课程讲解了QIIME下载安装、Linux命令、测序数据处理、OTU注释、Venny图热图绘制、样品Alpha及Bet...