m6A RNA甲基化5分文章套路(肿瘤分型/RNA修饰)试学
时间:2019-07-30 来源:生信自学网 作者:乐伟
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| m6A RNA甲基化 RNA修饰是一种转录后水平的调控方式，目前已鉴定到超过150种RNA修饰，它们广泛分布于各类RNA，如信使RNA（mRNA）、转运RNA（tRNA）、核糖体RNA（rRNA）、非编码小RNA（sncRNA）和长链非编码RNA（lncRNA）。 课程视学视频： RNA甲基化修饰约占所有RNA修饰的60%以上，而m6A（6-甲基腺嘌呤）是高等生物mRNA上最为常见的一类RNA甲基化修饰。转录本m6A的修饰水平受甲基转移酶（编码器）、结合蛋白（读码器）和去甲基化酶（消码器）的动态调控。 甲基转移酶（编码器）：KIAA1429、METTL3、METTL14、RBM15、WTAP、ZC3H13 结合蛋白（读码器）：HNRNPC、YTHDC1、YTHDC2、YTHDF1、YTHDF2 去甲基化酶（消码器）：ALKBH5、FTO  生信自学网新课程目录： m6A文章套路简介 数据下载 数据整理 基因名转换 提取m6A相关基因表达量 m6A相关基因差异表达 m6A热图绘制 m6A小提琴图绘制 m6A相关性分析 肿瘤分型 主成分分析 临床数据下载 临床信息提取 分型生存分析输入文件准备 分型生存分析 分型临床相关性输入文件准备 分型与临床相关性检验 分型临床相关性热图绘制 生存模型输入文件准备 单因素COX分析 lasso回归模型 风险生存曲线 ROC曲线 风险临床相关性输入文件准备 风险与临床相关性检验 风险与临床相关性热图 独立预后输入文件准备 单因素独立预后分析 多因素独立预后分析   生信自学网新课程《m6A RNA甲基化5分文章套路》即将上线 生信自学网为您推荐： 1、GEO基础课程 2、TCGA基础课程差异分析生存分析 3、TCGA免疫浸润模式挖掘 4、GO富集分析 5、单基因发文套路挖掘基于TCGA 6、R绘图脚本 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
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