CGGA数据库挖掘试学视频(胶质瘤研究/单基因批量
时间:2019-09-02 来源:生信自学网 作者:乐伟
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试学视频 课程主要内容：CGGA数据库简介，CGGA数据下载，批次矫正，表达和生存时间合并，生存分析过滤，独立预后分析过过滤，ROC曲线过滤，临床相关性过滤，挑选基因和生存输入文件准备，单基因生存曲线，单因素独立预后分析，多因素独立预后分析，ROC曲线绘制，临床相关性分析输入文件准备，临床相关性分析，GSEA输入文件准备，GSEA富集分析，多GSEA富集图，共表达分析，相关性热图绘制，相关性圈图绘制。 CGGA数据库是一个用户友好的网络应用程序，用于数据存储和分析，以探索来自中国队列2000多个样本的脑肿瘤数据集。该数据库包括全外显子测序（286）、DNA甲基化（159）、mRNA测序（1018）、mRNA微阵列（301）和microRNA微阵列（198）以及匹配的临床数据。分析工具允许用户浏览DNA突变谱、mRNA/micorrna表达谱和甲基化谱，并对特定的胶质瘤亚型进行相关性和生存率分析。
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