TCGA数据库双硫死亡文章套路视频(药物敏感性/免
时间:2023-04-13 来源:生信自学网 作者:伏泽
微信公众号:biowolf_cn 点击:次
课程目录:
双硫死亡文章套路简介,软件准备,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,区分mRNA和lncRNA,提取双硫死亡基因的表达量,共表达分析,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,桑基图,lncRNA表达和生存数据合并,构建预后模型,分组的临床统计分析,相关性热图,生存分析,PFS分析(无进展生存期),风险曲线,独立预后分析,ROC曲线,C-index曲线,列线图,临床分组的模型验证,主成分分析,风险差异分析,GO富集分析,KEGG富集分析(通路),GSEA富集分析,肿瘤微环境,肿瘤微环境差异分析,免疫细胞浸润,免疫细胞差异分析,免疫相关功能差异分析,瀑布图输入文件,瀑布图,肿瘤突变负荷差异分析,肿瘤突变负荷生存分析,免疫逃逸和免疫治疗,药物敏感性分析(oncoPredict),药物敏感性差异分析。
(责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |