生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

SEER数据库的数据下载不同于其他数据库，之前我们用到的如GEO数据库，TCGA数据库，都可以直接网页下载数据，而SEER数据库下载数据相对来说复杂一些，找到相关的数据就不容易，而且需要账号和密码才能下载数据，需要提交一个签名的保证书。

SEER数据库：美国国立癌症研究所“监测、流行病学和结果数据库”SEER是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一，收集了大量循证医学的相关数据，为临床医师的循证实践及临床医学研究提供了系统的证据支持和宝贵的第一手资料。

SEER数据库内容：数据记录中包括患者的注册编码、个人信息、原发病灶部位、肿瘤尺寸、肿瘤编码、治疗方案、死亡原因等信息。

数据库所涉及的肿瘤划分为9类：

乳腺、结肠  直肠、其他消化系统、女性生殖、淋巴 白血病、男性生殖、呼吸系统、泌尿系统及其他尚未确指的类型。

SEER数据库内容：

yr1973_2013.seer9：该目录保存了1973～2013期间由SEER第九登记站提交的部分州县的肿瘤研究数据。具体州县为：亚特兰大、康涅狄格、底特律、夏威夷、爱荷华、墨西哥、旧金山、弗朗西斯科、奥克兰、西雅图和犹他州普吉特海湾。

yr1992_2013.sj_la_rg_ak： 该目录保存了1992-2013期间部分州县的肿瘤研究数据。具体州县为：圣若泽、洛杉矶、蒙特雷、格鲁吉亚和阿拉斯加农村。

yr2000_2013.ca_ky_lo_nj_ga：该目录保存了2000-2013期间部分州县的肿瘤研究数据。具体州县为：大加利福尼亚、肯塔基、路易斯安那、新泽西和大格鲁吉亚。

yr2005.lo_2nd_half： 该目录保存了2005年期问路易斯安那州的肿瘤诊断情况。