CEO数据库单基因分析软件的准备
时间:2020-07-23 来源:生信自学网 作者:刘鑫
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软件的准备在进行CEO数据库单基因分析之前,我们先要在我们的电脑上安装Perl和R两个软件,Perl主要是处理我们的文本和我们的数据,对我们的数据进行整理,R则是对统计和绘图方面非常强大。此外我们还会安装Bioconductor的一个R包库,用以处理生物学图形的绘制和数据统计。首先我们要安装perl ,打开浏览器,搜索perl进入perl的官网主页,进入主页之后点击download,之后根据自己的系统选择合适的版本下载。在安装的过程中,不要选择含有中文和空格的路径,防止运行出错。 安装完成后,打开cmd输入perl -v,如果出现以下信息,说明perl安装成功。 接下来我们进行R的安装,同样在浏览器搜索R,进入主页,进入下载页面,选择好镜像和操作系统即可下载。安装过程中的路径同样不要出现中文和空格。 安装好R后,我们要安装Bioconductor包,要安装这个包我们要在网页中搜索limma bioconductor,进入主页,复制如图的命令,在R中运行,即可安装好Bioconductor包。 (责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |
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