String蛋白互作网络
时间:2024-06-14 来源:生信自学网 作者:伏泽
微信公众号:biowolf_cn 点击:次
1、浏览器打开网址：
https://cn.string-db.org/
主页选择“SEARCH”
2、进入之后，左侧菜单选择“Multiple proteins”
复制自己准备好的基因列表
右侧填写框List Of Names里面黏贴这些基因
Organisms下拉框选择物种-Homo sapiens，点击Select
接下来点击下面的“SEARCH”按钮
3、进入新的页面，把页面拉倒最下方，选择CONTINUE按钮
4、进入蛋白互作网络页面，拉到页面中部，选择Settings
找到network display options:
选上hide disconnected nodes in the network前面的选项框
然后找到UPDATE按钮，更新网络
5、选择Exports按钮，导出结果
分别选择
下载图片“same PNG format, but at higher resolution”
下载结果文件“TSV: tab separated values - can be opened in Excel and Cytoscape (lists only one-way edges: A-B)”
6、打开Cytoscape
选择菜单File-Import-Network from file
导入前面保存的string_interactions_short.tsv
导入之后照着视频15节讲解的操作
 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
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