TCGA数据库基因表达差异和生存分析(生存曲线SC
时间:2017-12-31 来源:原创 作者:森莘
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生物信息学定制服务,TCGA数据库科单个基因分析,多个基因还有优惠,需要的赶紧,能发表SCI文章的高清图片,需要的学员请直接联系QQ2749657388。 生物信息都是老师本人分析,图形都是高清图,可以帮助大家发表论文使用。提供图形可直接用于文章发表文章,是高清的tiff格式图片(≥400dpi)。 主要内容如下: 1. 从TCGA数据库下载转录组FPKM数据,lncRNA数据,miRNA数据,以及临床数据。 2. 数据整理,并且加上gene type。 3. 提取客户指定基因的生存数据(也可以某种癌症全部基因的生存分析)。 4. 下载临床数据,并将客户指定基因和生存数据合并。 5. 差异分析,绘制柱状图和散点图。 6. 生存分析,绘制生存曲线并计算高低组五年生存率(文章中必须要要有五年生存率)。 图1:TCGA单个基因表达量散点图 图2:TCGA单个基因生存曲线 (责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |