Cox比例风险回归模型发文思路
时间:2019-07-31 来源:原创 作者:biowolf.cn
微信公众号:biowolf_cn 点击:次
| 上次推文之后，有很多学员问到ceRNA、Cox风险模型、GEO多芯片联合分析、甲基化与基因联合分析的分析思路，我们在之前发文的基础上，给大家总结思路，希望对大家有帮助，当然最实惠的办法是学习课程，最高效的办法是找我们直接做分析。 1、数据下载
从TCGA数据库下载level3的RNA-seq数据 数据下载差异分析可以学习：TCGA基础课程
4、单因素Cox分析 5、多因素Cox分析 风险模型：
同时绘制生存曲线
6、ROC曲线 7、使用survival R包绘制ROC曲线7、风险曲线和热图
根据公式和每个样品的表达量得到每个样本的生存打分
8、独立预后因子 想得到上面的表和图可以学习：GO富集分析
10、kegg富集分析 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
|
- 上一篇：TCGA甲基化分析再续经典课程
- 下一篇：甲基化和基因表达联合分析