TCGA数据库肿瘤突变负荷分析(TMB/tumor mutation burd
时间:2019-07-30 来源:生信自学网 作者:乐伟
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TCGA数据库肿瘤突变负荷
生信自学网新课程《TCGA数据库肿瘤突变负荷分析》即将上线肿瘤突变负荷是一个比较热门的分析，而且频繁用于各大医院临床应用，通过肿瘤突变负荷的程度，可以预测生存期，以及病人的免疫治疗的疗效。 课程分四部分的内容： 第一部分： 肿瘤突变负荷简介 TMB就是肿瘤组织每兆碱基中突变的总数。通俗的讲，就是肿瘤基因的突变密度，也就是肿瘤基因组中平均有多少突变，包括基因编码错误、碱基替换、基因插入和确实错误的总数。 一定程度上可以理解成单位区域内发生变换的密度总量越大，肿瘤突变负荷（TMB）越高，那么可能相应的肿瘤相关的致癌突变越多，每个肿瘤的个性就越突出，越不同于正常细胞。 肿瘤免疫治疗的精髓就是通过各种方法换气、加强机体的免疫系统对肿瘤的杀伤。这种情况下，肿瘤突变负荷（TMB）越大，即突变越大的癌细胞，越不想正常细胞，越容易被免疫细胞发现，越容易成为肿瘤免疫的靶子，从而理论上讲越有可能对免疫治疗有效。 TMB越高的肿瘤病人对于免疫反应的效果越好。现在已知：高TMB可以帮助预测肿瘤免疫治疗在肺癌、膀胱癌、黑色素瘤等肿瘤病人中的疗效。 生信自学网提供专业生信视频教程 突变数据下载 生信自学网提醒学员所有数据请从TCGA官网下载  突变数据常见图形    计算肿瘤突变负荷  第二部分： 临床数据下载和整理 TMB和生存关系 TMB和临床性状关系  第三部分：TMB和基因表达的关系 差异分析 根据肿瘤突变负荷中位值把样本分两组，做差异分析 差异热图 GO富集分析 KEGG富集分析 第四部分： 免疫浸润细胞 突变和免疫浸润关系  点击进入购买生信视频课程 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
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