糖酵解预后模型模型基因cbioportal突变情况
时间:2020-03-29 来源:生信自学网 作者:乐伟
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| 糖酵解预后模型模型基因cbioportal突变情况 网址：https://www.cbioportal.org  1、进入页面，在中间的搜索框输入疾病关键词“stomach”，点击搜索，就可以看到结果页面，找到胃癌的相关信息，找到TCGA官网相关对应的数据“Stomach Adenocarcinoma(TCGA,PanCancer Atlas)”，然后把该数据前面的勾选框选上  2、点击“Query By Gene”，进入选页面，在Select Genomic Profiles选择“Mutations”、“Putative copy-number alterations from GISTIC”，第二栏选择默认的样本就行，在Hint框内输入我们的模型基因，比如输入“STC1 CLDN9 VCAN PLOD2 CXCR4”，在搜索框下方出现绿色“All gene symbols are valid”，说明输入的基因都检查到，可以做接下来的分析  3、点击“Submit Query”，进入结果页面  纵坐标：模型基因 模型基因在所有肿瘤样品的突变频率 横坐标：所有肿瘤样品 灰色代表没有突变，不同颜色代表不同突变类型 图片上方有“Download”按钮，可以根据自己的需求下载图片格式  4、点击页面中的“Mutations”按钮，可以进入每个基因的结果页面，在图片的右上角，有下载按钮，可以根据自己的需求下载图片格式   购买课程《糖酵解预后模型文章套路》 精品课程推荐： 《TCGA免疫相关基因预后模型》 《TCGA免疫相关lncRNA预后模型》 《免疫基因对文章套路挖掘》 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
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