CEO数据库单基因分析数据的下载
时间:2020-07-23 来源:生信自学网 作者:刘鑫
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数据下载安装好软件以后我们就要下载GEO的数据,首先我们通过网址进入GEO的主页https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/,搜索我们我们需要的数据,点击查询。在查询到的结果里面,我们通过筛选、过滤得到32个与人有关的数据,在其中我们挑选大于100个样品的数据,我们就点进去查看,如果里面大部分都是正常的样品,那我们就排除不用,继续查找下一个,直到我们找到了合适的数据,也就是大部分是肿瘤样品的数据,我们就可以将这个数据下载下来。 下载数据时,我们需要用到的有矩阵数据和平台文件。矩阵是我们之后要用到的探针的矩阵数据,我们需要把它下载下来。 而平台文件里面有我们探针和基因的对应关系,所以我们需要吧这个文件下载下来方便做后续分析。 (责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |