批量挖掘lncRNA数据下载

时间:2020-09-04  来源:生信自学网   作者:刘鑫   
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批量挖掘lncRNA数据下载 这个课程是关于TCGA数据库长非编码RNA批量挖掘的视频课程，我们会编写几篇文章为大家详细讲解该套课程的主要内容，如果大家对该套课程有需要，或是感兴趣的话，可以通过下方的课程链接购买相关的视频课程学习，里面有全部的视频内容和我们提供的脚本文件。 下面我们先大家讲解如何下载我们的数据，要下载数据，我们需要到我们的TCGA官网上下载，不推荐其他网站，因为数据很有可能不是最新的。我们打开TCGA的官网https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga 打开官网后，我们点击access TCGA Data进入数据界面 然后点击按钮Repository进入数据下载的界面，在下载数据前，我们要先将cart里的所有数据清空，清空后回到下载界面，通过左边的列表找到我们要研究的疾病类型，比如我们要研究胰腺癌，我们就将胰腺癌前面的方框勾上。 然后选择TCGA数据库，后面的性别等类型大家可以根据实际情况选择筛选条件，想我们这就默认全选。 选择好类型后，我们要选择文件类型，我们做长非编码RNA的话，是要下载转录组文件，所以我们要下载转录组测序的数据，之后再选择基因的表达和count数目。 选择好这些之后，我们就可以将筛选好的数据加入到cart中，这样就剩最后一步下载了。 进入cart购物车，里面就有我们添加进去的数据，我们要下载三个文件，分别是Mannifest文件，Cart文件和MetaData文件，其中Cart文件可能会因为文件太大下载不下来，所以我们可以通过命令行下载。 文件下载好后，我们将下载好的文件整理到一个文件夹中，这样我们需要的数据就下载好了。 课程链接： TCGA数据库批量挖掘lncRNA视频 相关课程： 长非编码RNA芯片数据挖掘视频 (责任编辑：伏泽   微信：18520221056)

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