转录组数据id转换以及临床数据的下载和整理

1、转录数据的id转换
通过前面数据的整理我们得到一个行名为id，列名为样品名的矩阵，接下需要为这个矩阵进行转换，得到
一个行名为基因的名称，列名为样品名的矩阵。需要用到symbol脚本，human配置文件，mRNAmatrix矩阵。

运行命令行即可得到id转换后的矩阵。

2、临床数据的下载
之后我们进行临床数据的下载
进入网页TCGA GDChttps://portal.gdc.cancer.gov/

清空购物车，进入下载界面
点击下载的疾病类型，项目等，根据自己的需求进行筛选

之后点击file进行临床数据的选择，最后添加到购物车里进行下载

在购物车中点击cart就可以进行下载，由于文件较小因此可以不用下载Manifest文件，
下载完后解压就行了

3、临床数据的整理
接下来进行临床数据的整理，需要用到临床数据和getClinical脚本文件，通过命令
行进行提取后就可以得到最终文件


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