TMB与免疫细胞浸润联合分析风险生存曲线和ROC曲
时间:2020-07-11 来源:生信自学网 作者:刘鑫
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风险生存曲线和ROC曲线以及CNV与免疫细胞的关系风险生存曲线和ROC曲线在我们构建好预后模型，根据预后模型的计算公式，我们就可以得到每个病人的风险值，根据风险值的中位值，我们可以把病人分为高低风险两组，我们可以比较两组之间生存是否具有差异，就可以绘制风险生存曲线 我们要准备的输入文件有，之前得到的风险文件，和我们的脚本文件。将脚本文件的工作路径设置好，复制粘贴到R中运行，等待完成，之后我们就可以得到我们的风险生存曲线图片和ROC曲线图片。  下面就是得到的风险生存曲线图形，在这个图形里面，横坐标是生存时间，纵坐标是生存率，根据我们风险值的中位值，我们可以得出高风险的病人生存率低于低风险的病人  接着是ROC曲线，ROC曲线可以看出风险生存曲线分析的准确率，ROC曲线下的范围越大，风险分析的准确率就越高。  CNV与免疫细胞的关系 在分析CNY与免疫细胞的关系前，我们需要用到timer,打开地址https://cistrome.shinyapps.io/timer/，在里面填写需要下载的数据类型，点击提交，等待一会，之后就会出来这样一个图形，我们就可以将这个图片下载下来，同理复制其他基因下载图片。     之后在网址首页点击Survival，输入STAD，点击Plot KM Curve,就可以生成免疫细胞的生存曲线图片   购买课程《肿瘤突变负荷联合免疫细胞浸润文章套路视频(TMB预后模型)》 精品课程推荐： 《泛癌多基因-基因家族文章套路》 《泛癌单基因文章套路》 《中药复方网络药理学》 《WGCNA四分文章套路》 《RNA结合蛋白RBP文章套路》 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
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