lncRNA批量生存分析
时间:2020-09-05 来源:生信自学网 作者:刘鑫
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lncRNA批量生存分析上一篇文章我们讲解了怎么把病人的生存时间和长非编码RNA的表达量合并,得到了一个和合并后的文件。有了这个文件,我们就可以做生存分析,下面我们具体讲解如何批量的做生存分析。我们要将长非编码RNA的生存分析图形一次性全部绘制出来,绘制出如下这些图形 这些图形,它们的横坐标是生存的时间,纵坐标是病人的生存率,从图中可以看出,随着时间的推移,病人的生存率是下降的,然后我们还按照长非编码RNA的中位值将病人分成了高低表达的两组,并且通过p值可以看出病人是生存是否具有差异,如果p值小于0.05,就说明高低表达组的生存是具有差异的。 从图形中还可以看出病人的生存率在高低表达组中的情况,前五个图,病人在高表达组的生存率是更高的,在最后一个图中病人的生存率在低表达组是更高的。 接着我们来绘制这些图形,我们要用到的输入文件是上一篇文章我们得到的病人的生存时间和长非编码RNA的表达量合并后的文件,还有我们事先准备好的脚本文件。 将脚本文件拷贝到R中运行之后,我们会得到每一个长非编码RNA的生存分析的图形,还有一个包含长非编码RNA的p值的表格文件。 这样长非编码RNA的批量生存分析就完成了,如果大家有什么疑问的话可以通过下方的联系方式联系我们,如果对该套课程感兴趣的话也可以购买我们的课程进行学习,下一篇我们讲解单因素和多因素的cox分析。 课程链接: TCGA数据库批量挖掘lncRNA视频 相关课程: 长非编码RNA芯片数据挖掘视频 (责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |
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