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多因素cox分析模型构建

多因素cox分析模型构建

       在单因素cos分析以后,我们挑选了单因素显著的一些长非编码RNA,接下来我们就要做多因素的cox分析,我们这里做多因素cox分析主要是为了构建生存模型,根据生存模型的公式计算每个病人的风险值。
      在多因素cox分析后,我们会得到一个表格,从这个表格里面我们可以得到长非编码RNA的系数、风险值、风险值波动范围、z值和pvalue。



        在做多因素的cox分析之前,我们需要先准备输入文件,输入文件是我们做单因素分析得到的7个长非编码RNA的表达量文件,然后就是我们提供的脚本文件。


        在运行脚本文件之前,我们先要在R中安装survival包和survminer包。


        运行完脚本后,我们可以得到3个结果文件,其中coxResult.xls里面就是我们上面提到的表格,forest.tiff是一个森林图,这是7个长非编码RNA过滤后得到的两个lncRNA的森林图。




        然后就是包含两个长非编码RNA的风险值的文件。这个文件我们做后续的很多分析都需要用到。


        最后,我们可以绘制一下经过过滤的lncRNA的森林图来看一下。

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