多因素cox分析模型构建

时间:2020-09-07  来源:生信自学网   作者:刘鑫   
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多因素cox分析模型构建        在单因素cos分析以后，我们挑选了单因素显著的一些长非编码RNA，接下来我们就要做多因素的cox分析，我们这里做多因素cox分析主要是为了构建生存模型，根据生存模型的公式计算每个病人的风险值。       在多因素cox分析后，我们会得到一个表格，从这个表格里面我们可以得到长非编码RNA的系数、风险值、风险值波动范围、z值和pvalue。         在做多因素的cox分析之前，我们需要先准备输入文件，输入文件是我们做单因素分析得到的7个长非编码RNA的表达量文件，然后就是我们提供的脚本文件。         在运行脚本文件之前，我们先要在R中安装survival包和survminer包。         运行完脚本后，我们可以得到3个结果文件，其中coxResult.xls里面就是我们上面提到的表格，forest.tiff是一个森林图，这是7个长非编码RNA过滤后得到的两个lncRNA的森林图。         然后就是包含两个长非编码RNA的风险值的文件。这个文件我们做后续的很多分析都需要用到。         最后，我们可以绘制一下经过过滤的lncRNA的森林图来看一下。 课程链接： TCGA数据库批量挖掘lncRNA视频 相关课程： 长非编码RNA芯片数据挖掘视频 (责任编辑：伏泽   微信：18520221056)

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