GEO数据下载

做免疫基因对的分析文章套路，我们还要下载一个数据，就是GEO的数据，我们可以通过网址进入GEO的主页https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/，搜索我们需要的数据，比如我们要做胃癌的分析，所以我们输入gastric cancer survival，然后点击查询。

在查询到的结果里面，我们通过筛选、过滤得到32个与人有关的数据，在其中我们挑选大于100个样品的数据，我们就点进去查看，如果里面大部分都是正常的样品，那我们就排除不用，继续查找下一个，直到我们找到了合适的数据，也就是大部分是肿瘤样品的数据，我们就可以将这个数据下载下来。

下载数据时，我们需要用到的有矩阵数据和平台文件。矩阵是我们之后要用到的探针的矩阵数据，我们需要把它下载下来。

而平台文件里面有我们探针和基因的对应关系，所以我们需要吧这个文件下载下来方便做后续分析。