GEO数据的注释

我们已经从GEO数据库下载好了探针的矩阵和平台文件，接下来我们就要对GEO的数据进行注释。下图是我们下载好的矩阵，它的行名探针的名字，列名是样品名。因为平台文件里面有探针和我们基因名字的对应关系，所以根据平台文件，我们就可以将我们的探针的矩阵转化为基因的名字，得到我们基因的矩阵。

我们要先准备好我们的输入文件，输入文件就是我们之前得到的平台文件和矩阵文件，我们先把矩阵压缩包解压，将解压后的文件里面的探针的矩阵文件全部拷贝出来放在一个新的txt中，命名为probeMatrix.txt，再将我们的平台文件重命名为ann.txt文件，这样我们的输入文件就准备好了。

之后我们打开cmd，用我们下载好的perl运行我们的脚本文件。运行完成后，我们就可以得到一个文件geoMatrix.txt，这个文件就是注释后的文件，也就是探针矩阵转化成基因名后的矩阵。