免疫相关基因对签名预测浆液性卵巢癌的总生存率（三）

验证IRGPI签名的生存预测
        为了验证IRGPI在不同风险组中是否具有一致的预后价值，我们将IRGPI签名应用于Bonome (GSE26712, n=185)20和Yoshihara (GSE32062, n=260) 21的两个独立验证组作为外部验证。将验证组的患者分为低高危组，比较生存率。与训练队列的结果相似，高危组患者的OS比低危组患者的OS短(图2B)。

在独立验证队列中进行测试时，IRGPI对HGSOC患者仍具有很高的预后价值(图3)。



不同危险人群的免疫细胞浸润
        已有研究报道肿瘤浸润性免疫细胞与预后相关。CIBERSORT可以估计免疫细胞亚群，并已在许多以前使用癌症微环境研究36 38。我们使用CIBERSORT来估计不同危险组患者22种不同免疫细胞的相对比例。图4A描述了这两个风险组产生的CIBERSORT输出的比较摘要。免疫细胞，如巨噬细胞M2, T细胞CD8和巨噬细胞M1在不同的危险组被富集(图4A)。我们发现，巨噬细胞M2在高危组显著高表达(P=0.007)，而T细胞CD8在低危组显著高表达(P=0.02，图4B)。既往研究显示M230巨噬细胞预后不良，而T细胞CD831预后较好。

 

IRGPI签名的功能评估
         为了探索IRGPI信号改变的生物学过程和信号通路，我们进行了GO分析和GSEA。GO分析显示，训练队列中的IRGPI签名基因主要参与对刺激的响应(图5)。

GSEA在高风险组和低风险组之间进行，以调查显著改变的通路。高危人群中，上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)、tgf -信号通路、细胞外基质信号通路和病灶黏附(false discovery rate, FDR) <0.01)等多种间充质表型相关通路(图6)。间充质表型相关通路的富集提供了IRGPI信号影响分子机制的证据，从而预测HGSOC的预后。

结论

        综上所述，我们系统地研究了免疫相关基因对签名的预后价值，为浆液性卵巢癌患者的管理提供风险评估。我们的免疫相关信号与浆液性卵巢癌患者的预后相关。这些免疫标记基因和IRGPI的生物学功能提供了进一步了解我们的预后标记在浆液性卵巢癌发展中的作用。这一特征将是一个有用的预测工具，以确定哪些患者可能受益于免疫治疗。