生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

  • TCGA下载和提取临床数据

    日期:2018-01-27 20:04:13 点击:46510 好评:48

    TCGA数据库包含大体量数据,其中非常关键的是临床数据,公开这些临床数据,对科研工作有非常大的帮助,那么下载和提取临床数据显得非常关键和重要,可以说,提取临床数据是研究TCGA数据...

  • ceRNA调控网络构建-TCGA数据库挖掘

    日期:2018-01-27 20:03:54 点击:13521 好评:10

    ceRAN网络构建是基于竞争性内源RNA(ceRNA)假说,TCGA数据库下载和提取lncRNA表达数据,用edgeR包分别做差异,得到差异lncRNA、差异mRNA和差异miRNA,通过数据库,...

  • TCGA数据库定制ceRNA网络图聚类图热图

    日期:2017-12-31 15:38:32 点击:2650 好评:10

    老师从事生信分析8年,全职为广大学员提供专业的生物信息学视频教材,提供专业生信分析,定制生信图文,绘图定制服务。...

  • TCGA数据库基因表达差异和生存分析(生存曲线SC

    日期:2017-12-31 15:15:16 点击:17332 好评:8

    图形都是高清图,可以帮助大家发表论文使用。提供图形可直接用于文章发表文章,是高清的tiff格式图片(≥400dpi)。...

  • TCGA数据库单个基因也可以做GSEA富集分析

    日期:2017-11-29 13:50:58 点击:3178 好评:-12

    TCGA数据库单个基因GSEA富集分析,需要提供癌症分析的基因,以及癌症分析的类型。...

  • TCGA数据库乳腺癌BRCA挖掘

    日期:2017-11-01 10:10:16 点击:6222 好评:6

    乳腺癌(breaster cancer)是发生于乳腺上皮或导管上皮的恶性肿瘤。TCGA数据库保存了1000多个乳腺癌样本,属于样本信息非常齐全的肿瘤,同时临床信息也很齐全,是临床分析和学术研究的...

  • TCGA数据库挖掘癌症肿瘤临床TNM分期

    日期:2017-10-31 15:28:44 点击:9986 好评:16

    TCGA数据库分析地位如此重要,比较主要的一个因素就是同时有表达量数据和临床数据,结合表达量数据和临床数据可以做很多分析,虽然没有SEER数据库肿瘤临床信息全面,但详细的TN...

  • TCGA数据库生存分析绘制5年生存曲线

    日期:2017-10-31 15:01:26 点击:9256 好评:0

    TCGA数据库挖掘,可以做表达量差异分析,临床分析,结合表达和临床可以做生存分析,生存分析为了探索和了解影响生存时间长短的因素,或平衡某些因素影响后,研究某个或某些因素...

  • TCGA数据库Counts和FPKM以及FPKM-UQ

    日期:2017-08-27 21:21:28 点击:29620 好评:28

    在做TCGA数据库分析时,下载基因表达矩阵时,遇到一个选项,需要选择Counts、FPKM、FPKM-UQ,很多学员有点困惑,这些都是什么区别呢?...

  • TCGA数据库数据类型速查

    日期:2017-08-23 22:47:37 点击:4301 好评:8

    TCGA数据库包括mRNA表达数据、microRNA表达数据、拷贝数数据、蛋白质数据、基因突变数据以及甲基化数据...