TCGA数据库包含大体量数据,其中非常关键的是临床数据,公开这些临床数据,对科研工作有非常大的帮助,那么下载和提取临床数据显得非常关键和重要,可以说,提取临床数据是研究TCGA数据...
ceRAN网络构建是基于竞争性内源RNA(ceRNA)假说,TCGA数据库下载和提取lncRNA表达数据,用edgeR包分别做差异,得到差异lncRNA、差异mRNA和差异miRNA,通过数据库,...
老师从事生信分析8年,全职为广大学员提供专业的生物信息学视频教材,提供专业生信分析,定制生信图文,绘图定制服务。...
图形都是高清图,可以帮助大家发表论文使用。提供图形可直接用于文章发表文章,是高清的tiff格式图片(≥400dpi)。...
TCGA数据库单个基因GSEA富集分析,需要提供癌症分析的基因,以及癌症分析的类型。...
乳腺癌(breaster cancer)是发生于乳腺上皮或导管上皮的恶性肿瘤。TCGA数据库保存了1000多个乳腺癌样本,属于样本信息非常齐全的肿瘤,同时临床信息也很齐全,是临床分析和学术研究的...
TCGA数据库分析地位如此重要,比较主要的一个因素就是同时有表达量数据和临床数据,结合表达量数据和临床数据可以做很多分析,虽然没有SEER数据库肿瘤临床信息全面,但详细的TN...
TCGA数据库挖掘,可以做表达量差异分析,临床分析,结合表达和临床可以做生存分析,生存分析为了探索和了解影响生存时间长短的因素,或平衡某些因素影响后,研究某个或某些因素...
在做TCGA数据库分析时,下载基因表达矩阵时,遇到一个选项,需要选择Counts、FPKM、FPKM-UQ,很多学员有点困惑,这些都是什么区别呢?...
TCGA数据库包括mRNA表达数据、microRNA表达数据、拷贝数数据、蛋白质数据、基因突变数据以及甲基化数据...