生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

  • 一项基于TCGA数据挖掘的研究(一)

    日期:2020-08-06 23:43:01 点击:3426 好评:0

    肿瘤微环境(TME)在肺腺癌(LUAD)的发生发展过程中起着至关重要的作用;然而,在理解TME中免疫和基质成分的动态调节仍然是一个挑战,所以我在这向大家分享这样一篇研究报道。...

  • 差异Venn图与id转化

    日期:2020-08-06 18:53:41 点击:3627 好评:0

    我们已经对基质细胞的分组和免疫细胞的分组分别做了差异分析,我们得到了两个差异的结果,接下来我们就把这两个差异的结果取交集, 得到交集的差异基因。...

  • 基质细胞与免疫细胞的分组差异分析

    日期:2020-08-06 15:52:36 点击:3581 好评:0

    我们得到肿瘤微环境的结果之后,我们就可以得到每个细胞基质细胞的打分和免疫细胞的打分,就可以比较哪些基因在这两组之间是具有差异的,然后我们就可以做差异分析。...

  • 肿瘤微环境联合免疫细胞浸润微环境生存分析与

    日期:2020-08-05 17:28:11 点击:3539 好评:0

    1、微环境生存分析 2、临床相关性分析...

  • 肿瘤微环境联合免疫细胞浸润微环境打分和生存

    日期:2020-08-05 12:17:50 点击:3145 好评:0

    我们已经计算好了肿瘤的微环境,得到了基质细胞和免疫细胞的打分,得到了这两个打分之后,我们就需要将这个免疫微环境的打分是跟我们的生存数据进行合并。...

  • 肿瘤微环境联合免疫细胞浸润临床信息的提取与

    日期:2020-08-05 00:09:45 点击:2883 好评:0

    下载好了临床数据以后,我们就需要对这样的数据进行了整理,整理好了临床数据后,我们讲解开始肿瘤微环境。...

  • 肿瘤微环境联合免疫细胞浸润id的转换和临床数据

    日期:2020-08-04 16:29:13 点击:2840 好评:0

    通过我们前面数据的整理,我们得到一个行名为id列名为样品名的矩阵,接下来我们需要对这个矩阵进行转换,得到一个行名为基因的名称,列名为样品名的一个矩阵。...

  • 肿瘤微环境联合免疫细胞浸润转录组数据的下载

    日期:2020-08-04 11:28:47 点击:2962 好评:0

    在做免疫细胞浸润之前,我们要下载转录组的数据,下载好了数据后,我们的每个样品都是一个文件,我们需要把它整理成矩阵。...

  • 肿瘤微环境联合免疫细胞浸润文章套路

    日期:2020-08-03 14:00:03 点击:3207 好评:0

    肿瘤微环境联合免疫细胞浸润文章套路 肿瘤微环境联合免疫细胞浸润,转录组数据下载,转录组数据整理,id转换,临床数据下载,临床数据整理,肿瘤微环境,肿瘤微环境打分和生存...

  • 透明细胞肾癌肿瘤突变负荷与免疫浸润的关系探

    日期:2020-07-14 13:44:22 点击:3443 好评:0

    TMB与生存结果、病理分期和肿瘤分级相关,低tmb和高tmb组基因表达谱的比较,识别hub tmb相关的免疫基因和突变体与免疫浸润的关系...