肿瘤微环境(TME)在肺腺癌(LUAD)的发生发展过程中起着至关重要的作用;然而,在理解TME中免疫和基质成分的动态调节仍然是一个挑战,所以我在这向大家分享这样一篇研究报道。...
我们已经对基质细胞的分组和免疫细胞的分组分别做了差异分析,我们得到了两个差异的结果,接下来我们就把这两个差异的结果取交集, 得到交集的差异基因。...
我们得到肿瘤微环境的结果之后,我们就可以得到每个细胞基质细胞的打分和免疫细胞的打分,就可以比较哪些基因在这两组之间是具有差异的,然后我们就可以做差异分析。...
我们已经计算好了肿瘤的微环境,得到了基质细胞和免疫细胞的打分,得到了这两个打分之后,我们就需要将这个免疫微环境的打分是跟我们的生存数据进行合并。...
下载好了临床数据以后,我们就需要对这样的数据进行了整理,整理好了临床数据后,我们讲解开始肿瘤微环境。...
通过我们前面数据的整理,我们得到一个行名为id列名为样品名的矩阵,接下来我们需要对这个矩阵进行转换,得到一个行名为基因的名称,列名为样品名的一个矩阵。...
在做免疫细胞浸润之前,我们要下载转录组的数据,下载好了数据后,我们的每个样品都是一个文件,我们需要把它整理成矩阵。...
肿瘤微环境联合免疫细胞浸润文章套路 肿瘤微环境联合免疫细胞浸润,转录组数据下载,转录组数据整理,id转换,临床数据下载,临床数据整理,肿瘤微环境,肿瘤微环境打分和生存...
TMB与生存结果、病理分期和肿瘤分级相关,低tmb和高tmb组基因表达谱的比较,识别hub tmb相关的免疫基因和突变体与免疫浸润的关系...