TCPA数据库预后相关蛋白绘制火山图
时间:2020-01-30 来源:生信自学网 作者:乐伟
微信公众号:biowolf_cn 点击:次
TCPA数据库预后相关蛋白绘制火山图 得到预后相关蛋白数据之后，我们就有了HR（风险值）和P值，可以用数据结果绘制火山图，这里用到的R包：ggolot2、ggrepel 安装方法：install.packages("ggplot2") install.packages("ggrepel") 首先调用R包： library(dplyr) library(ggplot2) library(ggrepel) HR>1为高风险蛋白，HR<1低风险蛋白 这里定义：横坐标log2(HR)，纵坐标-log10(pvalue) 根据分组进行打点，分别是高风险蛋白，低风险蛋白，不显著蛋白，同时对显著蛋白进行标注，提高图片的可视性  生信自学网精品课程推荐： 《TCGA数据库m6A套路挖掘》 《TCGA单基因文章套路挖掘》 《中药复方网络药理学联合GEO芯片》 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
|
- 上一篇：TCPA数据库筛查预后相关蛋白
- 下一篇：TCPA数据库蛋白预后模型构建