绘制多指标ROC曲线
时间:2020-11-10 来源:生信自学网 作者:刘鑫
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绘制多指标ROC曲线这一次我们向大家讲解如何绘制ROC曲线,首先我们可以来看一下今天要绘制的ROC曲线我们得到这样一个图形,这个图形它的横坐标就是假阳性率,纵坐标的话就是真阳性率,我们绘制ROC曲线的话,这里是将我们的风险值的曲线,跟我们的其他的临床性状的曲线一起绘制,然后进行比较。我们这个ROC的话主要是看曲线下的面积,如果曲线下的面积越大的话,就说明我们这个模型的准确性越高,这个曲线下的面积它是介于0-1之间。如果他越接近于1的话,就说明我们这个模型的准确性是越高的,我们可以看一下这里曲线下的面积,我们是用AUC值表示。我们可以看到我们的风险值得到的AUC值是0.686。然后我们其他临床性状得到的AUC值,它的值都是小于0.6的。就说明通过我们的这个模型得到的风险值他的预测的准确性比我们其他临床性状去预测病人的生存的准确性要高,这就是我们的多指标ROC曲线。 下面我们来绘制这样的ROC曲线,我们要准备的输入文件是独立预后分析得到的输入文件,这是我们上一篇文章中得到的。 有了这个文件,我们只需要运行我们的R语言脚本文件,我们就可以得到这样一个ROC曲线。 购买课程: 《免疫相关lncRNA文章套路视频课程》 精品课程推荐: 《TCGA数据库甲基化分型文章套路》 《GEO数据库miRNA芯片挖掘》 《中药复方网络药理学联合GEO芯片》 (责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |
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